Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTV1Q96GA3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTV1Q96GA3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms