Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIRT1Q96EB6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms