Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FAM3DQ96BQ1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FAM3DQ96BQ1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FAM3DQ96BQ1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FAM3DQ96BQ1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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