Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKL1Q969V6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms