Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms