Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP9XQ93008 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms