Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSH3Q8TE77 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms