Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL22A1Q8NFW1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL22A1Q8NFW1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms