Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET6

CHST13, Carbohydrate sulfotransferase 13, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST13Q8NET6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST13Q8NET6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST13Q8NET6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms