Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNNM3Q8NE01 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms