Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG10Q8N0Z9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG10Q8N0Z9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms