Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf40Q8IXQ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms