Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPAS3Q8IXF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS3Q8IXF0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms