Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HS2ST1Q7LGA3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms