Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms