Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP47Q6ZTR5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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