Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HRCT1Q6UXD1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms