Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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