Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms