Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms