Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC62Q6P9F0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC62Q6P9F0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms