Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RWDD4Q6NW29 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms