Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms