Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LCN10Q6JVE6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms