Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf84Q5VXU9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf84Q5VXU9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms