Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms