Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms