Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms