Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms