Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A3Q4VXF1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms