Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC14Q49A88 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC14Q49A88 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms