Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms