Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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