Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CCDC142Q17RM4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CCDC142Q17RM4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CCDC142Q17RM4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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