Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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