Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms