Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIX1Q15475 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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