Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3CQ15386 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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