Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF4Q15306 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms