Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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