Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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COL19A1Q14993 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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COL19A1Q14993 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL19A1Q14993 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL19A1Q14993 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL19A1Q14993 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL19A1Q14993 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL19A1Q14993 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL19A1Q14993 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL19A1Q14993 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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COL19A1Q14993 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms