Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms