Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPSQ13938 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPSQ13938 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPSQ13938 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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