Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
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