Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms