Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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