Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTBP1Q13363 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms