Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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