Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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NR1H3Q13133 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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