Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms